Il  Centro di Riferimento per la Modellistica sulla Qualità dell'Aria (CRMQA) è stato attivato presso ARPAT, secondo quanto previsto dalla regione Toscana con il Piano Regionale di Azione Ambientale (PRAA) 2007-2010 e dalla "Carta dei servizi e delle attività" di ARPAT, per lo svolgimento di compiti connessi allo studio e all'applicazione pratica della modellistica sulla qualità dell'aria. In particolare:

• Acquisizione e sviluppo continuo di strumenti modellistici: questa attività si struttura in tre azioni, che costituiscono il nucleo fondamentale dell’attività tecnica del CRMQA: acquisizione ed  elaborazione dell’archivio delle emissioni, acquisizione ed elaborazione dell’archivio dei dati meteorologici, acquisizione e implementazione dei codici di calcolo relativi ai modelli di impatto atmosferico.
• Coordinamento delle competenze: l'azione di coordinamento si sostanzia nella disponibilità del CRMQA ad essere un luogo di confronto tecnico aperto ai diversi soggetti attivi in Toscana che operano nel settore, ed è basata innanzi tutto sulla conoscenza delle effettive competenze e sulla verifica della disponibilità dei soggetti a cooperare con il Centro.
• Certificazione e accessibilità dei dati: la funzione di certificazione e accessibilità dei dati e delle metodologie di ricerca e applicazione della modellistica ambientale è direttamente conseguente alla finalità di coordinamento delle competenze tecniche di cui al punto precedente e di trasferimento di dati, risultati e metodologie.
• Applicazioni su richiesta degli Enti e dei Dipartimenti provinciali ARPAT: il CRMQA effettua applicazioni modellistiche finalizzate alla realizzazione di mappe di concentrazione a supporto della valutazione e gestione della qualità dell’aria, per le quali sono utilizzati codici di simulazione della dispersione degli  inquinanti primari e secondari che stimano, sul lungo periodo, le concentrazioni e le deposizioni dei principali inquinanti atmosferici, al fine di confrontare l’efficacia di scenari emissivi alternativi.
• Linee guida per la redazione di studi di impatto atmosferico: il CRMQA redige documenti di indirizzo in cui sono esplicitati gli elementi essenziali per una corretta procedura di valutazione di  impatto atmosferico tramite l’impiego di modelli  matematici, anche distinguendo gradi di approfondimento diversi corrispondenti a progressivi livelli di affinamento dei risultati.
• Aggiornamenti internazionali, partecipazione ad eventi e Progetti Europei: questa attività è necessaria per mantenere e accrescere il livello di conoscenza e completezza tecnica della modellistica ambientale tramite la periodica verifica dello stato di avanzamento delle conoscenze e competenze, l'apprendimento dei suggerimenti o indicazioni delle problematiche da affrontare e approfondire formulate dalle Agenzie europee e nordamericane, e la partecipazione alle azioni di armonizzazione che sono in corso da decenni in Europa.
• Disseminazione delle metodologie di modellistica ambientale: il CRMQA promuove azioni di formazione e disseminazione presso i Dipartimenti provinciali ARPAT, le Provincie e altri Enti pubblici o privati sulle procedure e sugli strumenti oggetto del patrimonio tecnico del Centro stesso.